Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Krt35Q497I4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Krt35Q497I4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms