Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc110Q3V125 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc110Q3V125 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms