Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Dnah12Q3V0Q1 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Dnah12Q3V0Q1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms