Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Lrrc43Q3V0L5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
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Lrrc43Q3V0L5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lrrc43Q3V0L5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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