Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Garnl3Q3V0G7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Garnl3Q3V0G7 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms