Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc27Q3V036 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc27Q3V036 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc27Q3V036 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms