Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nr1d1Q3UV55 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nr1d1Q3UV55 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms