Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm6899Q3USS0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm6899Q3USS0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms