Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
D13Ertd608eQ3UPR8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms