Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cobll1Q3UMF0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Cobll1Q3UMF0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms