Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cnep1r1Q3UJ81 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cnep1r1Q3UJ81 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms