Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rsph3aQ3UFY4 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rsph3aQ3UFY4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms