Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rrp36Q3UFY0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rrp36Q3UFY0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms