Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Trafd1Q3UDK1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Trafd1Q3UDK1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms