Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atxn7l3bQ3UD01 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atxn7l3bQ3UD01 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms