Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D9

UPF0602 protein C4orf47 homolog, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U1D9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Q3U1D9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3U1D9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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