Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Palb2Q3U0P1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Palb2Q3U0P1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms