Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pip4p1Q3TWL2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pip4p1Q3TWL2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms