Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ccndbp1Q3TVC7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccndbp1Q3TVC7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms