Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccbe1Q3MI99 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccbe1Q3MI99 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms