Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cd300lgQ1ERP8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cd300lgQ1ERP8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms