Protein–RNA interactions for Protein: Q14DL3

Lrriq3, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 633 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq3Q14DL3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrriq3Q14DL3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrriq3Q14DL3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms