Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps8Q0P5W1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps8Q0P5W1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms