Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Ubxn2bQ0KL01 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn2bQ0KL01 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms