Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ttc21bQ0HA38 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ttc21bQ0HA38 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms