Protein–RNA interactions for Protein: Q09XV5

Chd8, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd8Q09XV5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Chd8Q09XV5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd8Q09XV5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd8Q09XV5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd8Q09XV5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd8Q09XV5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd8Q09XV5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd8Q09XV5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd8Q09XV5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd8Q09XV5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd8Q09XV5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd8Q09XV5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Chd8Q09XV5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Chd8Q09XV5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms