Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Slc7a1Q09143 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Slc7a1Q09143 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms