Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Pate4Q09098 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Pate4Q09098 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms