Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp2Q08652 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms