Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdf3Q07104 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gdf3Q07104 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms