Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Atf4Q06507 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Atf4Q06507 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms