Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Apoc2Q05020 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Apoc2Q05020 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms