Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox13Q04891 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sox13Q04891 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms