Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Sox9Q04887 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sox9Q04887 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms