Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Sox8Q04886 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Sox8Q04886 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms