Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Emx2Q04744 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Emx2Q04744 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms