Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Scg2Q03517 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Scg2Q03517 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms