Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Ddr1Q03146 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ddr1Q03146 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms