Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Epha4Q03137 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epha4Q03137 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms