Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col6a2Q02788 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a2Q02788 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms