Protein–RNA interactions for Protein: Q02257

Jup, Junction plakoglobin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JupQ02257 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JupQ02257 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JupQ02257 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JupQ02257 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JupQ02257 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JupQ02257 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
JupQ02257 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
JupQ02257 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JupQ02257 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
JupQ02257 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms