Protein–RNA interactions for Protein: Q02111

Prkcq, Protein kinase C theta type, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcqQ02111 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PrkcqQ02111 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PrkcqQ02111 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms