Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Snai1Q02085 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snai1Q02085 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms