Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rbp4Q00724 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp4Q00724 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rbp4Q00724 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms