Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Apoa1Q00623 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Apoa1Q00623 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms