Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GabpaQ00422 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GabpaQ00422 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms