Protein–RNA interactions for Protein: Q00288

Pax8, Paired box protein Pax-8, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax8Q00288 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pax8Q00288 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms