Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PgrQ00175 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
PgrQ00175 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PgrQ00175 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PgrQ00175 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms