Protein–RNA interactions for Protein: P97950

Rab33a, Ras-related protein Rab-33A, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33aP97950 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rab33aP97950 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rab33aP97950 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms