Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pitx2P97474 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pitx2P97474 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms